FMOプログラムABINIT-MPの次世代化
概要
本課題では、フラグメント分子軌道(FMO)計算プログラムABINIT-MPのGPU化等の高速化と共に、開殻・多参照系への対応を進めています。また、GPUを最初から意識したFMO-Xの新規開発も行っています。併せて、タンパク質の立体構造を予測するAlphaFoldのライブラリ整備もしています。
関連Webページ
報告書等
研究紹介ポスター/最終報告書
業績一覧
(1) 学術論文 (査読あり)
[]Yoshitaka Moriwaki*, Taro Shiraishi, Yohei Katsuyama, Kenichi Matsuda, Jie Zhang, Toyoyuki Ose, Atsushi Minami, Hideaki Oikawa, Tomohisa Kuzuyama, Ryuichiro Ishitani, Tohru Terada, "High-throughput prediction of protein–protein interactions uncovers hidden molecular networks in biosynthetic gene clusters", Computational and Structural Biotechnology Journal, 35 (2026) csbj.0149.
(2) 国際会議プロシーディングス (査読あり)
該当なし
(3) 国際会議発表(査読なし)
該当なし
(4) 国内会議発表(査読なし)
[]"機械学習によるタンパク質内相互作用エネルギーの予測に関する最新動向"(口頭)土居英男*,芳根僚平, 高谷大輔,福澤薫,森義治,加藤幸一郎,田中成典,奥脇弘次,望月祐志, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/3.
[]"RI近似を用いたFMO法のGPUによる高速化"(口頭)中野達也*, 坂倉耕太, 成瀬彰, 片桐孝洋, 星野哲也, 大島聡史, 中島研吾, 石川岳志, 望月祐志, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/5.
[]"GPUアクセラレータ環境におけるMP2電子相関計算の性能最適化"(口頭)坂倉耕太*, 中野達也, 星野哲也, 大島聡史, 片桐孝洋, 望月祐志, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/5.
[]"「富岳」~「富岳NEXT」時代のフラグメント分子軌道(FMO)計算"(口頭)望月祐志*, 中野達也, 坂倉耕太, 土居英男, 芳根僚平, 奥脇弘次, 高谷大輔, 福澤薫, 加藤幸一郎, 田中成典, 星野哲也, 大島聡史, 中島研吾, 片桐貴洋, 第31回計算工学講演会, 名古屋, 2026/6/5.
[]"GPU時代に向けた量子化学プログラムABINIT-MPの性能最適化"(口頭:依頼)坂倉耕太, スーパーコンピュータ「不老・弐」へ向けたユーザ集会~AI for Scienceを支援するAI/エージェントスパコン稼働に向けて~, 名古屋, 2026/9/8.
[]"タンパク質-リガンド相互作用のテンソル分解によるデータ解析"(口頭)土居英男*, 奥谷星太郎, 小野寺光海, 新井大貴, 山本詠士, 平野秀典, 泰岡顕治, 田中成典, 福澤薫, 望月祐志, 応用物理学会秋期年会2026, 札幌, 2026/9/10.
(5) 公開したライブラリなど
該当なし
(6) その他(特許,プレスリリース,著書等)
[]"フラグメント分子軌道法とは?", 望月祐志*, 田中成典, 福澤薫, 現代化学, 661(2026年4月号), 45-48.
[]"FMOプログラムと高速処理 - 超並列計算とGPUへの対応", 中野達也, 坂倉耕太, 望月祐志*, 現代化学, 662(2026年5月号), 51-54.
[]"FMO相互作用解析 - MD法と連携した動的解析", 田中成典*, 福澤薫, 望月祐志, 現代化学, 663(2026年6月号), 55-58.
[]HAIRDESC/RIST – 計算科学技術特論B (配信講義 2026/6/4&11) – ABINIT-MPプログラムによるフラグメント分子軌道(FMO)計算 1&2 – 望月祐志
[]Kiyoshi Tanaka, Takahiro Katagiri, Tatsuya Nakano, Yuji Mochizuki*, An Algorithm for computing Three- and Four-Body Density Matrices from CASCI Wavefunction and AI-Assisted Code Optimization
[]"感染症とFMO計算", 田中成典*, 福澤薫, 川下理日人, 望月祐志, 現代化学, 667(2026年10月号), 57-60.